Un buen artículo el de Ani López, Multi categories website structure. Who needs the canonical tag?

En el artículo se pone en duda la utilidad real que puede tener el reciente anuncio de los principales buscadores de Internet de soportar el tag <link rel="canonical" href="…"/>.

if you have to do profuse use of canonical tag you have a web structure problem.

La solución pasa por reflejar coherentemente la arquitectura de información en la estructura de la urls, en vez de tener contenido duplicado por todas partes.